Τα παιδιά που έρχονται στον κόσμο με τη βοήθεια της καισαρικής τομής έχουν περισσότερες πιθανότητες να εκδηλώσουν αλλεργίες, σύμφωνα με έρευνα που παρουσιάστηκε πρόσφατα στην ετήσια συνάντηση της Αμερικανικής Ακαδημίας Αλλεργιών, Άσθματος και Ανοσολογίας, στο Τέξας.  Για τις ανάγκες της έρευνας μελετήθηκαν δεδομένα από περισσότερα από 1200 μωρά όταν ήταν ενός, έξι, δώδεκα και εικοσιτεσσάρων μηνών. Φάνηκε ότι στην ηλικία των δύο ετών, τα παιδιά που είχαν γεννηθεί με καισαρική είχαν πενταπλάσιες πιθανότητες να εκδηλώσουν αλλεργίες όταν εκτίθενται σε κοινά αλλεργιογόνα όπως η σκόνη ή το τρίχωμα των κατοικιδίων.  Σύμφωνα με την επικεφαλής της έρευνας Κριστίν Κόλουλ Τζόνσον, «τα ευρήματα αυτά ενισχύουν την υπόθεση ότι η πρώιμη επαφή ενός νεογνού με τα βακτήρια που βρίσκονται στο γεννητικό κανάλι της μητέρας του ενισχύουν σημαντικά το ανοσοποιητικό του σύστημα. Αντίθετα, τα μωρά που γεννιούνται με καισαρική έχουν στο γαστρεντερικό τους σύστημα περισσότερους μικροοργανισμούς που καθιστούν τον οργανισμό τους πιο ευαίσθητο στο να αναπτύξει αντισώματα ανασογλοβουλίνης Ε (IgE) όταν εκτεθεί σε αλλεργιογόνα». To συγκεκριμένο αντίσωμα συνδέεται με την εκδήλωση αλλεργιών και άσθματος.